中央政府行政院所属的机关。成立于民国八十五年十二月十日。职掌为统筹处理有关原住民事务，并对省（市）政府执行有关事务，有指导及监督之责。设有教育文化处、卫生福利处、经济及公共建设处、土地管理处及文化园区管理局等。